23 июня 1941 года военный трибунал Особого Прибалтийского военного округа в соответствии с приказом председателя военной коллегии Верховного Суда СССР был преобразован в военный трибунал Северо-Западного фронта, а в последующем с 1944 года – в военный трибунал 2-го Белорусского фронта. Возглавил данный трибунал бригвоенюрист Галенков И.С. У трибунала фронта в подведомственности было около 100 трибуналов разных уровней, в том числе: военные трибуналы 1-го, 12-го, 14-го гвардейских стрелковых корпусов, 44-го стрелкового корпуса, 1-й, 4-й ударных армий, 9-й, 22-й, 34-й, 53-й армий, 6-й воздушной армии, 7-й, 22-й, 28-й гвардейских стрелковых дивизий, 27-й артиллерийской дивизии, 53-й, 282-й, 391-й стрелковых дивизий, 37-й отдельной стрелковой дивизии и другие.

Ивановский гарнизонный военный суд был сформирован 4 декабря 1993 года. Этому событию предшествовали Директивы Генерального штаба Вооруженных Сил Российской Федерации от 27 ноября 1992 года № 314/8/1309 и 1-го заместителя Министра обороны Российской Федерации от 11 августа 1992 года № 314/1/0771, согласно которым военный суд Северной группы войск, дислоцированный в городе Легница Польской Республики был расформирован в связи с выводом Российских войск из стран Восточной Европы.